Nat Commun：AlphaFold2新方法高通量预测蛋白质构象分布，准确率超80%

  美国布朗大学分子和细胞生物学与生物化学系的科研人员在Nature Communications上发表了题为“High-throughput prediction of protein conformational distributions with subsampled AlphaFold2”的文章。研究团队提出了一种使用AlphaFold 2通过亚采样多序列比对直接预测不同蛋白质构象相对种群的创新方法，并对两个具有截然不同可用序列数据的蛋白质进行核磁共振实验，即Abl1激酶和粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子（GM-CSF），该方法以超80%的准确率预测了相对状态种群的变化。此外，亚采样方法在用于定性预测突变或进化对蛋白质构象分布和高密度状态的影响时效果最好。综上，该方法高效、迅速且成本较低，能有效预测蛋白质构象的相对种群，甚至可达到单点突变的分辨率，有望成为药理学、实验结果分析和预测进化的有用工具。论文原文：Monteiro da Silva, G., Cui, J.Y., Dalgarno, D.C. et al. Author Correction: High-throughput prediction of protein conformational distributions with subsampled AlphaFold2. Nat Commun 15, 3089 （2024）. https://doi.org/10.1038/s41467-024-47504-0