近日,重医附一院临床分子医学检测中心程伟教授团队在国际著名期刊Nucleic Acids Research(《核酸研究》)发表了题为“Rapid in situ RNA imaging based on Cas12a thrusting strand displacement reaction”(《基于Cas12a 驱动链置换反应的RNA原位成像》)的研究成果。该团队研发了一种RNA快速原位成像新方法,能在1小时内完成肿瘤细胞/组织中RNA的原位检测,展现出很好的临床应用前景。
据介绍,RNA原位成像是揭示癌症发生发展和时空异质性的重要手段。传统的荧光原位杂交技术(FISH)存在耗时长、操作繁琐和效率低等不足。链置换反应(SDR)是一种基于核酸链结合解离的核酸检测技术,具有等温、无酶等优点,在生物医学领域具有广泛的应用前景。然而,SDR相对较低的催化效率和初始能量依赖性导致其在RNA原位检测应用中面临重大挑战。
该团队研究发现,Cas12a/crRNA 复合物可通过增加 SDR 初始反应能量和降解DNA 单链副产物,推动 SDR 反应平衡正向进行,显著提升 SDR 扩增效率。基于此,团队发展了基于Cas12a助推链置换反应(CtSDR)的快速RNA原位成像新方法。临床试验结果证明,该方法能在1小时内完成肿瘤组织中EB病毒RNA的原位成像检测,与临床常规使用的原位杂交方法(检测时间>14小时)结果完全一致。
团队研发的CtSDR技术为临床分子诊断和RNA表达研究提供了一种全新的技术手段,具有广阔的应用前景(已申请发明专利202211389269.4)。该研究获得国家自然科学基金、重庆市高校创新研究群体、重庆医科大学“揭榜挂帅”等项目资助。
据悉,重医附一院临床分子医学检测中心程伟教授团队长期致力于临床分子诊断新原理新技术的研发和临床应用研究。近年来,团队以临床需求为导向,聚焦肿瘤分子标志物原位成像新方法研究,已相继在Theranostics,ACS Sensors(ESI高被引),Nucleic Acids Research,Small等重要学术期刊发表系列研究成果,为肿瘤分子分型提供了新的技术支撑。
(临床分子医学检测中心)